bueno, tomando la idea de death, el otro día hice uno parecido a su idea, en este caso hace uso de star y ncftp para hacer un respaldo al vuelo:

cd /var/lib/mysql
for bd in `ls|egrep -v mysql`
do
if [ -d $bd ]; then
mysqldump $bd -uroot -pclavemysql | gzip -c - | ncftpput -c -u usuarioftp -p claveftp servidor.dominio.com /$item.gz
fi
done
exit 0


saludos!
epe