Una forma sencilla de instalar desde las fuentes resolviendo dependencias al vuelo es utilizando auto-apt.

Instalamos auto-apt:

apt-get install auto-apt


Actualizamos:

auto-apt update
auto-apt updatedb
auto-apt update-local


Ahora en el path que contiene el configure del programa a instalar desde las fuentes:

auto-apt run ./configure
./configure


Verificamos que todo este en orden:

apt-get install checkinstall
checkinstall -D make install


Mas sencillo imposible :)

Estas instrucciones tambien aplican para Ubuntu.